若您是貨到付款或是金融匯款，財政部無法得知〔除非被人密告您沒開發票〕
但若是線上刷卡則銀行一定有紀錄，財政部一定查的到。
根據財政部公告課稅標準
每月銷售額小於6萬元，不必課徵營業稅。
每月銷售額大於6萬元小於20萬元，小規模營業人，免用統一發票，稅率1%。
每月銷售額大於20萬元，大店戶營業人，應用統一發票，稅率5%。
更多的討論，請參考網路拍賣課稅
簡單的說：
您的網站內若啟用線上刷卡，且每個月刷卡的交易金額大於6萬，國稅局可能會找上你，但國稅局較喜歡查年營業額上千萬的公司，若您是小小的個體戶其實被查的機會不大，但如果你很衰的話還是有機會被國稅局查(或許是被人檢舉漏開發票)，建議您可以去申請免用統一發票就不必害怕了。
PS：商品是否開立發票是由您自行決定負責。
